Девочка-пингвин

События сериала сосредоточены на девушке по имени Ноль Два, чье имя представляет собой специальный код, используемый в ее окружении. В начале повествования у главной героини наблюдаются проблемы с памятью неизвестного происхождения. Она помнит только период заточения, в то время как события до заключения полностью стерты из ее сознания. В памяти периодически возникают фрагменты воспоминаний о женщине, выполнявшей роль матери, которая сыграла значительную роль в формировании личности девушки.

Постепенно к Ноль Два возвращается воспоминание о том, как эта женщина принесла ей книгу с иллюстрациями. В ходе развития сюжета раскрывается, что несколько лет назад над героиней проводились нестандартные эксперименты в лаборатории под названием "Сад". В этом учреждении Ноль Два встречает мальчика по имени Хиро, имеющего код Ноль Шестнадцать. Они совместно предпринимают попытку побега из лаборатории, которая заканчивается неудачей.

После провала побега обоим персонажам полностью стирают память, в результате чего они забывают друг о друге. Однако в определенный момент Ноль Дта начинает восстанавливать воспоминания о человеке, к которому испытывала симпатию, и принимает решение найти его любыми доступными способами. Это становится основной движущей силой дальнейшего развития сюжета.